Объект культурного наследия регионального (республиканского) значения. Постановление Совета Министров ТАССР от 27.07.1987 №320 "О включении в список памятников истории и культуры объектов г.Казани".
Точное время постройки храма и создания прихода неизвестно. Антиминс датирован 1781 годом, метрические книги велись с 1784 г., во всяком случае, в 1774 году храма еще не было. Храм с самого начала был двухпрестольным – придел во имя Жен Мироносиц. Это была довольно крупная церковь, выстроенная в традициях классицизма. В 1901-1907 гг. храм перестроен по проекту архитектора Ф.Н.Малиновского. Фактически была построена новая церковь, старая кладка стен сохранилась лишь фрагментами, первоначальный облик сохранили притвор и нижние ярусы колокольни.
Перестройка проводилась на средства самой церкви и лишь в небольшой части – на пожертвования. 2 февраля 1864 г. в Варваринской церкви венчались Николай Евгеньевич Баратынский (сын известного поэта и отец известного общественного деятеля Александра Баратынского) и Ольга Александровна Казем-Бек, дочь выдающегося востоковеда. В 80-е гг. XIX в. в хоре церкви неоднократно пел Федор Иванович Шаляпин. 25 апреля 1903 г. здесь был крещен будущий поэт Николай Алексеевич Заболоцкий (1903-1958).
В 1918-1919 гг., после закрытия кремлевских храмов Варваринская церковь служила крестовой церковью управляющего епархией епископа Анатолия (Грисюка) и фактически играла роль кафедрального собора. В 1930 году храм был закрыт и передан под клуб Трамвайного парка, позже в нем находилась одна из кафедр и лаборатория КХТИ. В 1995 году храм возвращен общине верующих.
Церковь с высокой четырехъярусной колокольней – образец псевдо-русского стиля.
Регистрационный номер в едином государственном реестре ОКН №161711110430005